Van egy nagy a felsőoktatást egész Kirgizisztánban. Ez magában foglalja a mintegy harminchét állami egyetemek és tizennyolc magánegyetemek. Prominens egyetemek Kirgizisztán közé Egyetem Közép-Ázsiában és a kirgiz Nemzeti Egyetemen.

A PhD képzés előfeltétele leggyakrabban a Mesterdiploma megléte. A követelmények között találjuk az elsősorban eredeti kutatáson alapuló disszertáció elkészítését is. Egyes országokban a doktorandusznak egy bizottság előtt kell megvédenie a munkáját.